Il villaggio di Bednárec si trova sul bordo sud-occidentale degli altopiani della Boemia e della Moravia nel distretto di Jindřichův Hradec, 10 km a nord-est di Jindřichův Hradec.
Il villaggio si trova sul versante nord-occidentale sopra la valle del fiume Žirovnička ad un'altitudine di 530 m.s.l.m. Il punto più alto sul territorio del comune è la collina "Myslivna" a 592 m.s.l.m., il punto più basso è la valle Žirovnička a 475 m.s.l.m. Il territorio catastale del comune ha una superficie di 781 ettari.
Ci sono diversi luoghi interessanti nel territorio di Bednárec, come la cappella della Vergine Maria nel villaggio, una cappella dedicata a S. Anna lungo la strada per Kamenný Malíkov, la croce di pietra "Sui binari" e altri piccoli monumenti sacri. Sulle rive dei meandri del fiume Žirovnička si trova la riserva naturale "Lipina". Una particolarità è il percorso della linea ferroviaria direttamente sopra il semirimorchio del villaggio su un terrapieno di diversi metri. Dalla parte alta del villaggio, chiamata "Kopec", c'è una bella vista sui dintorni vicini e più lontani: Jindřichhohradecko, Kamenicko, ma anche Novohradské hory e Šumava. Con una visibilità eccezionalmente buona, è anche possibile vedere le Alpi.
Ad est del villaggio c'è una cascata di quattro bellissimi stagni nei Černý les (Jílků malý, Šedivů, Obecní velgy e Obecní malý), sotto questa cascata più al confine del territorio catastale del comune si trova lo stagno Holub.