Das Dorf Bednárec liegt am südwestlichen Rand der Böhmisch-Mährischen Höhe im Bezirk Jindřichův Hradec, 10 km nordöstlich von Jindřichův Hradec.
Das Dorf liegt am nordwestlichen Hang über dem Tal des Flusses Žirovnička auf einer Höhe von 530 m.ü.M. Der höchste Punkt auf dem Gebiet der Gemeinde ist der Berg „Myslivna“ mit 592 m ü.dM, der niedrigste Punkt ist das Žirovnička-Tal mit 475 m ü. Das Katastergebiet der Gemeinde hat eine Fläche von 781 Hektar.
Auf dem Gebiet von Bednárec gibt es mehrere interessante Orte, wie die Kapelle der Jungfrau Maria im Dorf, eine Kapelle, die dem hl. Anne an der Straße nach Kamenný Malíkov, der Kreuzstein „Auf den Gleisen“ und andere kleine sakrale Denkmäler. An den Ufern der Mäander des Flusses Žirovnička befindet sich das Naturschutzgebiet „Lipina“. Eine Besonderheit ist die Trassierung der Bahnlinie direkt über dem Sattelauflieger des Dorfes auf einer mehrere Meter hohen Böschung. Vom oberen Teil des Dorfes, "Kopec" genannt, hat man eine schöne Aussicht auf die nähere und weiter entfernte Umgebung: Jindřichhohradecko, Kamenicko, aber auch das Novohradské hory und den Böhmerwald. Bei außergewöhnlich guter Sicht ist es auch möglich, die Alpen zu sehen.
Östlich des Dorfes befindet sich eine Kaskade von vier schönen Teichen in den Černý les (Jílků malý, Šedivů, Obecní velgy und Obecní malý), unterhalb dieser Kaskade liegt weiter an der Grenze des Katastergebiets der Gemeinde der Holub-Teich.