Die erste schriftliche Erwähnung von Bratrušov stammt aus dem Jahr 1371 und ist das Testament des mährischen Markgrafen John Henry (Bruder Karls IV.), Der seinem Sohn Prokop mehrere Dörfer, darunter Bratrušov, hinterließ.
Sowohl der tschechische als auch der deutsche Name Brattersdorf leiten sich vom tschechischen Personennamen Bratruš ab und bedeuten „Bratrušs Dorf“. Diese Interpretation zeigt, dass das Dorf wahrscheinlich von den Slawen gegründet wurde, wahrscheinlich vor der großen Kolonialisierung, die von deutschen Siedlern im 13. und 14. Jahrhundert in den böhmischen Ländern durchgeführt wurde. Bratrušov ist seine längliche Form entlang der Straße, die Aufteilung des Landes in Felder, die sich hinter den Wohnungen erstrecken, aber ein typisches deutsches Kolonisationsdorf.
1603 wurde eine All Saints Church im Stil der Spätrenaissance errichtet, um nicht katholischen Gottesdiensten zu dienen. 1784 wurde ein katholisches Pfarrhaus eingerichtet. Zu dieser Zeit begann der Schulunterricht wahrscheinlich in Privathäusern und um 1800 wurde ein Schulgebäude gebaut. Bis 1834 war das Dorf gewachsen und es gab 140 beschreibende Zahlen und 809 Einwohner. Bratrušov war ein vorgebirgisches Bauerndorf, die einzige Produktionsstätte war zu dieser Zeit eine Wassermühle, und ihre Bewohner fanden häufig Arbeit in Industrieanlagen in der Nähe von Šumperk. Die Bevölkerung von Bratrušov war von der Mitte des 19. Jahrhunderts bis zum Zweiten Weltkrieg konstant und erreichte ihren Höhepunkt 1900, als 1016 Einwohner in 149 Häusern lebten, von denen bis auf zwei Ausnahmen alle die deutsche Staatsangehörigkeit beanspruchten. Nach 1918 bildete sich hier allmählich die tschechische Minderheit, und 1930 waren 88 der 980 Einwohner Tschechen. Kein Wunder also, dass Henleins Sudetendeutsche Partei die Wahlen von 1935 und Bratrušov gewann. Zwischen 1945 und 1948 wurde die deutsche Bevölkerung vertrieben und das Dorf neu besiedelt. 1960 war die Siedlung Osikov mit Bratrušov verbunden, aber beide Dörfer waren zwischen 1980 und 1990 mit Šumperk verbunden. Der Wechsel erfolgte erst 1990, als Bratrušov wieder eine eigenständige Gemeinde wurde.